MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 254494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019673	ACC	2	6	8	13	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601839
2	NC_019673	GCC	2	6	58	63	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
3	NC_019673	GCA	2	6	78	83	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601839
4	NC_019673	GC	3	6	84	89	0 %	0 %	50 %	50 %	433601839
5	NC_019673	CG	3	6	226	231	0 %	0 %	50 %	50 %	433601839
6	NC_019673	CCG	2	6	277	282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
7	NC_019673	GCCGAT	2	12	312	323	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433601839
8	NC_019673	CCG	2	6	337	342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
9	NC_019673	CCG	2	6	359	364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
10	NC_019673	CGA	2	6	396	401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601839
11	NC_019673	GAG	2	6	412	417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601839
12	NC_019673	CGC	2	6	429	434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
13	NC_019673	GCG	2	6	461	466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601839
14	NC_019673	TCG	2	6	511	516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601839
15	NC_019673	CGG	3	9	587	595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601839
16	NC_019673	CCCG	2	8	613	620	0 %	0 %	25 %	75 %	433601839
17	NC_019673	CTG	2	6	673	678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601839
18	NC_019673	GAG	2	6	742	747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601839
19	NC_019673	ACGA	2	8	751	758	50 %	0 %	25 %	25 %	433601839
20	NC_019673	TCA	2	6	761	766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433601839
21	NC_019673	CGA	2	6	777	782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601839
22	NC_019673	GCG	2	6	801	806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601839
23	NC_019673	TGC	2	6	824	829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601839
24	NC_019673	TGG	2	6	830	835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601839
25	NC_019673	AAGG	2	8	859	866	50 %	0 %	50 %	0 %	433601839
26	NC_019673	AGG	2	6	872	877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601839
27	NC_019673	TTC	2	6	880	885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433601839
28	NC_019673	TCC	2	6	931	936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433601839
29	NC_019673	GCC	2	6	942	947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
30	NC_019673	GGA	2	6	966	971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601839
31	NC_019673	GCC	2	6	1017	1022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
32	NC_019673	AAG	2	6	1054	1059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433601839
33	NC_019673	GCC	2	6	1060	1065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
34	NC_019673	CGCC	2	8	1082	1089	0 %	0 %	25 %	75 %	433601839
35	NC_019673	GC	3	6	1145	1150	0 %	0 %	50 %	50 %	433601839
36	NC_019673	TGC	2	6	1217	1222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601839
37	NC_019673	CGA	2	6	1265	1270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601839
38	NC_019673	CCG	2	6	1283	1288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
39	NC_019673	TTC	2	6	1291	1296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433601839
40	NC_019673	GAC	2	6	1309	1314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601839
41	NC_019673	GACC	2	8	1386	1393	25 %	0 %	25 %	50 %	433601839
42	NC_019673	CGG	2	6	1422	1427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601839
43	NC_019673	ACG	2	6	1438	1443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601839
44	NC_019673	AAG	2	6	1459	1464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433601839
45	NC_019673	GCC	2	6	1487	1492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601839
46	NC_019673	AGC	2	6	1532	1537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601839
47	NC_019673	GC	3	6	1536	1541	0 %	0 %	50 %	50 %	433601839
48	NC_019673	CG	3	6	2583	2588	0 %	0 %	50 %	50 %	433601840
49	NC_019673	GCC	2	6	2604	2609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601840
50	NC_019673	GGT	2	6	2623	2628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601840
51	NC_019673	GGA	2	6	2649	2654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601840
52	NC_019673	GCG	2	6	2711	2716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601840
53	NC_019673	CGG	2	6	2736	2741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601840
54	NC_019673	CCGG	2	8	2756	2763	0 %	0 %	50 %	50 %	433601840
55	NC_019673	ACC	2	6	2795	2800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601840
56	NC_019673	GC	3	6	2851	2856	0 %	0 %	50 %	50 %	433601840
57	NC_019673	CGG	2	6	2972	2977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601840
58	NC_019673	GAC	2	6	2983	2988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601840
59	NC_019673	ACCG	2	8	3052	3059	25 %	0 %	25 %	50 %	433601840
60	NC_019673	CGA	2	6	3096	3101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601840
61	NC_019673	ACG	2	6	3146	3151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601840
62	NC_019673	CTCG	2	8	3192	3199	0 %	25 %	25 %	50 %	433601840
63	NC_019673	ACG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601840
64	NC_019673	CCGG	2	8	3233	3240	0 %	0 %	50 %	50 %	433601840
65	NC_019673	ACC	3	9	3244	3252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601840
66	NC_019673	GCT	2	6	3255	3260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601840
67	NC_019673	GCT	2	6	3288	3293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601840
68	NC_019673	CCGA	2	8	3295	3302	25 %	0 %	25 %	50 %	433601840
69	NC_019673	CGG	2	6	3308	3313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601840
70	NC_019673	CCG	2	6	3425	3430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601840
71	NC_019673	GAC	2	6	3436	3441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601840
72	NC_019673	GAG	3	9	3454	3462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601840
73	NC_019673	ACCT	2	8	3511	3518	25 %	25 %	0 %	50 %	433601840
74	NC_019673	CAC	2	6	3567	3572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601840
75	NC_019673	GCC	2	6	3578	3583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601840
76	NC_019673	GCT	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601840
77	NC_019673	TACCTG	2	12	3631	3642	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	433601840
78	NC_019673	TCG	2	6	3730	3735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601841
79	NC_019673	CCG	2	6	3773	3778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601841
80	NC_019673	CG	3	6	3777	3782	0 %	0 %	50 %	50 %	433601841
81	NC_019673	GGT	2	6	3791	3796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601841
82	NC_019673	TGG	2	6	3847	3852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601841
83	NC_019673	CGC	2	6	3860	3865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601841
84	NC_019673	CG	3	6	3868	3873	0 %	0 %	50 %	50 %	433601841
85	NC_019673	GCCG	2	8	3890	3897	0 %	0 %	50 %	50 %	433601841
86	NC_019673	CTG	2	6	3936	3941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601841
87	NC_019673	CGG	2	6	3965	3970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601841
88	NC_019673	CGA	2	6	3986	3991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601841
89	NC_019673	GAA	2	6	3995	4000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433601841
90	NC_019673	CGG	2	6	4052	4057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601841
91	NC_019673	CGG	2	6	4094	4099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601841
92	NC_019673	CG	3	6	4159	4164	0 %	0 %	50 %	50 %	433601841
93	NC_019673	AGG	2	6	4165	4170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601841
94	NC_019673	CTG	2	6	4272	4277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601841
95	NC_019673	CGA	2	6	4309	4314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601841
96	NC_019673	GGTCC	2	10	4340	4349	0 %	20 %	40 %	40 %	433601841
97	NC_019673	GCT	2	6	4352	4357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601841
98	NC_019673	CTG	2	6	4362	4367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601841
99	NC_019673	CG	3	6	4371	4376	0 %	0 %	50 %	50 %	433601841
100	NC_019673	GAC	2	6	4398	4403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601841
101	NC_019673	GGA	2	6	4418	4423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601841
102	NC_019673	GAG	2	6	4449	4454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601841
103	NC_019673	CCG	2	6	4489	4494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601841
104	NC_019673	GAC	2	6	4524	4529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601841
105	NC_019673	CGCC	2	8	4531	4538	0 %	0 %	25 %	75 %	433601841
106	NC_019673	GC	3	6	4541	4546	0 %	0 %	50 %	50 %	433601841
107	NC_019673	CGC	2	6	4550	4555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601841
108	NC_019673	CGG	2	6	4571	4576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601841
109	NC_019673	TTCCGG	2	12	4604	4615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601841
110	NC_019673	CA	3	6	4619	4624	50 %	0 %	0 %	50 %	433601841
111	NC_019673	TCG	2	6	4717	4722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601842
112	NC_019673	GACG	2	8	4799	4806	25 %	0 %	50 %	25 %	433601842
113	NC_019673	GC	3	6	4825	4830	0 %	0 %	50 %	50 %	433601842
114	NC_019673	CG	4	8	4831	4838	0 %	0 %	50 %	50 %	433601842
115	NC_019673	GTG	2	6	4839	4844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601842
116	NC_019673	GGT	2	6	4853	4858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601842
117	NC_019673	GCT	2	6	4874	4879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601842
118	NC_019673	CGG	2	6	4897	4902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
119	NC_019673	GCCGCG	2	12	4940	4951	0 %	0 %	50 %	50 %	433601842
120	NC_019673	GGA	2	6	4991	4996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601842
121	NC_019673	GCG	2	6	5011	5016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
122	NC_019673	GCG	3	9	5027	5035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
123	NC_019673	CGA	2	6	5042	5047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601842
124	NC_019673	GCT	2	6	5048	5053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601842
125	NC_019673	AGC	2	6	5110	5115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601842
126	NC_019673	GCG	2	6	5116	5121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
127	NC_019673	GCT	2	6	5123	5128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601842
128	NC_019673	CGGT	2	8	5139	5146	0 %	25 %	50 %	25 %	433601842
129	NC_019673	CGG	2	6	5152	5157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
130	NC_019673	GCT	2	6	5210	5215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601842
131	NC_019673	TGG	2	6	5233	5238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601842
132	NC_019673	CGC	2	6	5248	5253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601842
133	NC_019673	CGGC	2	8	5292	5299	0 %	0 %	50 %	50 %	433601842
134	NC_019673	GCAC	2	8	5341	5348	25 %	0 %	25 %	50 %	433601842
135	NC_019673	GGA	2	6	5363	5368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601842
136	NC_019673	GGTC	2	8	5429	5436	0 %	25 %	50 %	25 %	433601842
137	NC_019673	CGA	2	6	5444	5449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601842
138	NC_019673	CGG	2	6	5534	5539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
139	NC_019673	TGC	2	6	5548	5553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601842
140	NC_019673	CGG	3	9	5616	5624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
141	NC_019673	GGC	4	12	5639	5650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
142	NC_019673	TCA	2	6	5662	5667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433601842
143	NC_019673	CGG	2	6	5671	5676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601842
144	NC_019673	GAG	2	6	5694	5699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601842
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146	NC_019673	GC	3	6	5707	5712	0 %	0 %	50 %	50 %	433601842
147	NC_019673	CTCG	2	8	5884	5891	0 %	25 %	25 %	50 %	433601843
148	NC_019673	GCG	2	6	5954	5959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601843
149	NC_019673	CGG	3	9	5980	5988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601843
150	NC_019673	GAC	2	6	6010	6015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601843
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152	NC_019673	CGG	2	6	6087	6092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601843
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156	NC_019673	CGG	2	6	6299	6304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601843
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159	NC_019673	CGA	2	6	6758	6763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601844
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161	NC_019673	CGG	2	6	6812	6817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601844
162	NC_019673	CGA	2	6	6830	6835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601844
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164	NC_019673	GGC	2	6	6915	6920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601844
165	NC_019673	CGG	2	6	6950	6955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601844
166	NC_019673	GTG	2	6	6978	6983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601844
167	NC_019673	GAG	2	6	7095	7100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601844
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169	NC_019673	ACC	2	6	7146	7151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601844
170	NC_019673	ACA	2	6	7156	7161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433601844
171	NC_019673	CAT	2	6	7217	7222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433601844
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174	NC_019673	GGA	2	6	7322	7327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601844
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178	NC_019673	CG	4	8	7544	7551	0 %	0 %	50 %	50 %	433601844
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248	NC_019673	GAG	2	6	10093	10098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601845
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250	NC_019673	CGA	2	6	10125	10130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601845
251	NC_019673	CGT	3	9	10197	10205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601845
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253	NC_019673	GCG	2	6	10268	10273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601845
254	NC_019673	GC	3	6	10289	10294	0 %	0 %	50 %	50 %	433601845
255	NC_019673	GAC	2	6	10306	10311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601845
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259	NC_019673	TTC	2	6	10357	10362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433601845
260	NC_019673	CAA	2	6	10365	10370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433601845
261	NC_019673	CTG	2	6	10447	10452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601845
262	NC_019673	GAG	2	6	10468	10473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601845
263	NC_019673	CCA	2	6	10529	10534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601845
264	NC_019673	GAA	2	6	10548	10553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433601845
265	NC_019673	GGT	2	6	10588	10593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601845
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268	NC_019673	TGCTC	2	10	10640	10649	0 %	40 %	20 %	40 %	433601845
269	NC_019673	GGA	2	6	10653	10658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601845
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272	NC_019673	CGA	2	6	10710	10715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601845
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279	NC_019673	TGG	2	6	10836	10841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601845
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392	NC_019673	GC	3	6	14874	14879	0 %	0 %	50 %	50 %	433601851
393	NC_019673	CGC	2	6	14898	14903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601851
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399	NC_019673	GTCA	2	8	15109	15116	25 %	25 %	25 %	25 %	433601851
400	NC_019673	CTCG	2	8	15200	15207	0 %	25 %	25 %	50 %	433601852
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496	NC_019673	GAG	2	6	18442	18447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601856
497	NC_019673	CGCCA	2	10	18450	18459	20 %	0 %	20 %	60 %	433601856
498	NC_019673	GCC	2	6	18472	18477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601856
499	NC_019673	CG	3	6	18490	18495	0 %	0 %	50 %	50 %	433601856
500	NC_019673	GCT	2	6	18504	18509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601856

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